Використання молекулярно-генетичних підходів у діагностиці варіантів гена Cftr: історична перспектива та власний досвід

  • О. Тищенко ТОВ «Науковий медико-генетичний центр «Леоген»», Україна, 79059, м. Львів, вул. Максимовича, 7г; Регіональний центр неонатального скринінгу, КНП «Львівський обласний клінічний перинаталь-ний центр», Україна, 79032, м. Львів, вул. Д. Вашингтона, 9 https://orcid.org/0009-0005-8376-9855
  • М. Тиркус ТОВ «Науковий медико-генетичний центр «Леоген»», Україна, 79059, м. Львів, вул. Максимовича, 7г; Національний університет ім. Івана Франка, Україна, 79000, м. Львів, вул. Грушевського, 4 https://orcid.org/0009-0006-9353-4707
  • І. Шиманська ТОВ «Науковий медико-генетичний центр «Леоген»», Україна, 79059, м. Львів, вул. Максимовича, 7г; Інститут спадкової паталогії НАН України, Україна, 79008, м. Львів, вул. Миколи Лисенка, 31-А https://orcid.org/0000-0002-4403-6166
  • Н. Матійців ТОВ «Науковий медико-генетичний центр «Леоген»», Україна, 79059, м. Львів, вул. Максимовича, 7г; Національний університет ім. Івана Франка, Україна, 79000, м. Львів, вул. Грушевського, 4 https://orcid.org/0000-0002-1582-2037
  • Г. Макух ТОВ «Науковий медико-генетичний центр «Леоген»», Україна, 79059, м. Львів, вул. Максимовича, 7г; Національний університет ім. Івана Франка, Україна, 79000, м. Львів, вул. Грушевського, 4; Регіональний центр неонатального скринінгу, КНП «Львівський обласний клінічний перинатальний центр», Україна, 79032, м. Львів, вул. Д. Вашингтона, 9 https://orcid.org/0000-0001-7749-5353
DOI: https://doi.org/10.7124/FEEO.v37.1748
Ключові слова: муковісцидоз, CFTR, молекулярна діагностика, NGS, MLPA

Анотація

Мета. Проаналізувати використання різних молекулярно-генетичних методів діагностики муковісцидозу, оцінити їх ефективність, переваги та обмеження, а також визначити оптимальні підходи для виявлення варіантів у гені CFTR. Методи. Було проведено аналіз даних національного реєстру пацієнтів із муковісцидозом та виконані лабораторні дослідження на базі Інституту спадкової патології та НМГЦ «Леоген». Результати. Показано, що комбіноване застосування методів першої лінії, що ідентифікують мажорні варіанти в популяції та MLPA дозволяє виявити до 80 % варіантів CFTR, а NGS забезпечує більш детальну ідентифікацію мутацій, включаючи рідкісні варіанти. Висновки. Найбільш ефективним підходом є етапна стратегія, що включає тестування поширених варіантів та подальше NGS-дослідження у разі негативного результату. Використання міжнародних стандартів HGVS та баз даних CFTR2 та NCBI є важливим для уніфікації діагностичних висновків.

Посилання

Bareil C., Bergougnoux A. CFTR gene variants, epidemiology and molecular pathology. Archives de Pédiatrie. 2020. Vol. 27. P. eS8–eS12. https://doi.org/10.1016/S0929-693X(20)30044-0.

Welsh M. J., Smith A. E. Molecular mechanisms of CFTR chloride channel dysfunction in cystic fibrosis. Cell. 1993. Vol. 73 (7). P. 1251–1254. https://doi.org/10.1016/0092-8674(93)90353-R.

Liu K., Xu W., Xiao M. et al. Characterization of clinical and genetic spectrum of Chinese patients with cystic fibrosis. 2020. https://doi.org/0.21203/rs.2.20219/v1.

Makukh G. V., Hnateyko O. Z., Zastavna D. V., et al. Methods of molecular genetic analysis of cystic fibrosis, phenylketonuria and Nijmegen syndrome. Lviv : Methodological recommendations, 2009. 28 p. [in Ukrainian]

Makukh G. V., Zastavna D. V., Tyrkus M. Ya. Method of DNA isolation from peripheral blood leukocytes. Pat. 32044 Ukraine: MPK G01N33/49 (2006.01) No. u200801896; appl. 14.02.2008; publ. 25.04.2008, Bull. No. 8. [in Ukrainian]