FNBP1 як регулятор пухлиногенезу: біоінформатичний аналіз та субклітинна локалізація у клітинах хронічної мієлоїдної лейкемії

  • А. С. Матвеенко Інститут молекулярної біології та генетики НАН України, Україна, 03680, м. Київ, вул. Акад. Заболотного, 150 https://orcid.org/0009-0002-4755-7132
  • С. В. Антоненко Інститут молекулярної біології і генетики НАН України, Україна, 03143, м. Київ, вул. Академіка Заболотного, 150 https://orcid.org/0000-0003-0212-3779
DOI: https://doi.org/10.7124/FEEO.v39.1828
Ключові слова: FNBP1, TCGA, пухлиногенез, хронічна мієлоїдна лейкемія, клітинна лінія К562

Анотація

Мета. Формін-зв’язуючий білок (FNBP1) є адапторним білком родини F-BAR, який відіграє ключову роль у регуляції актинового цитоскелету та мембранної динаміки. Методи. Біоінформатичний аналіз експресії FNBP1 у різних типах онкологічних захворювань з використанням даних Cancer Genome Atlas (TCGA) та Genotype-Tissue Expression (GTEx). Імунофлуоресцентний аналіз локалізації FNBP1 у клітинах К562 з подальшою конфокальною мікроскопією. Результати. Біоінформатичний аналіз з баз даних Cancer Genome Atlas (TCGA) та Genotype-Tissue Expression (GTEx) свідчить про потенційну клінічну значущість FNBP1 як біомаркера і терапевтичної мішені, оскільки його експресія корелює з прогнозом захворювання та рівнем імунної інфільтрації. Показано цитоплазматичну локалізацію FNBP1 із частковим накопиченням у перинуклеарній зоні, що може свідчити про його залучення до процесів везикулярного транспорту, ремоделювання мембран та організації цитоскелету. Висновки. Отриманні дані узгоджуються із багатофункціональною роллю FNBP1 в динаміці цитоскелету, мембранного трафіку, а також підкреслює його важливе значення у клітинній міграції та інвазії, що робить його перспективною терапевтичною мішенню для терапії злоякісних новоутворень.

Посилання

Antonenko S., Gurianov D., Telegeev G. Colocalization of USP1 and PH domain of Bcr-Abl oncoprotein in terms of chronic myeloid leukemia cell rearrangements, Cytology and Genetics. 2016. Vol. 50. Р. 11–15. https://doi.org/10.3103/S0095452716050029.

Antonenko S., Kravchuk I., Telegeev G. Interaction of Bcr-Abl oncoprotein with the GlG1 protein in K562 cells: Its role in the pathogenesis of chronic myeloid leukemia. Cytology and Genetics. 2020. Vol. 54. Р. 48–54. https://doi.org/10.3103/s0095452720010028.

Antonenko S., Telegeev G. Inhibition of USP1, a new partner of Bcr-Abl, results in decrease of Bcr-Abl level in K562 cells. Experimental Oncology. 2020. Vol. 42. Р. 109–114. https://doi.org/10.32471/exp-oncology.2312-8852.vol-42-no-2.14533.

Antonenko S. V., Gurianov D. S., Kravchuk I. V. Role of BCR and FNBP1 proteins in phagocytosis as a model of membrane rearrangements with chronic myelogenous leukemia. Cytology and Genetics. 2023. Vol. 57. Р. 291–297. https://doi.org/10.3103/S0095452723040023.

Сancer Genetics. FNBP1. Retrieved from: https://www.cancer-genetics.org/FNBP1.htm.

FNBP1 – Formin-binding protein 1 – Homo sapiens (Human). UniProt. Retrieved from: https://www.uniprot.org/uniprotkb/H0Y7W6/entry.

GEPIA2. Retrieved from: http://gepia2.cancer-pku.cn/#analysis.

Katoh M., Katoh M. Identification and characterization of human FNBP1L gene in silico. International Journal of Molecular Medicine. 2004. Vol. 13 (1). Р. 157–162.

National Library of Medicine Gene: FNBP1. Retrieved from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gtr/genes/23048/.

Taylor K. L., Taylor R. J., Richters K. E. Opposing functions of F-BAR proteins in neuronal membrane protrusion, tubule formation, and neurite outgrowth. Life Science Alliance. 2019. Vol. 2 (3). https://doi.org/10.26508/lsa.201800288.

Wang Z., Tian Z., Song X. Membrane tension sensing molecule-FNBP1 is a prognostic biomarker related to immune infiltration in BRCA, LUAD and STAD. BMC Immunology. 2022. Vol. 23 (1). https://doi.org/10.1186/s12865-021-00475-z.

Yoon B. K., Hwang N., Chun K. H. Sp1-Induced FNBP1 Drives Rigorous 3D Cell Motility in EMT-Type Gastric Cancer Cells. International Journal of Molecular Sciences. 2021. Vol. 22 (13). https://doi.org/10.3390/ijms22136784.

Zeni C., Komiya Y., Habas R. Formin Binding Protein 1 (FNBP1) regulates non-canonical Wnt signaling and vertebrate gastrulation. Developmental Biology. 2024. Р. 18–29. https://doi.org/10.1016/j.ydbio.2024.06.019.

Zhang J., Li X., Zhou Y., Lin M., Zhang Q., Wang Y. FNBP1 Facilitates Cervical Cancer Cell Survival by the Constitutive Activation of FAK/PI3K/AKT/mTOR Signaling. Cells. 2023. Vol. 12 (15). https://doi.org/10.3390/cells12151964.

Zhang L., Li F., Zhang L. RBM15B/IGF2BP2-m6A Mediated Upregulation of FNBP1 Promotes the Progression of Glioblastoma by Promoting Smad3-Mediated Glycolysis. Drug Development Research. 2025. Vol. 86 (7). https://doi.org/10.1002/ddr.70175.